中层为别传寺景观层。别传别寺建于康熙元年（公元1662年），为明末抗清义士、高僧澹归和尚所建，是岭南十大丛林之一。该层的主要景观有杰阁晨钟、松涧涛风、竹坡烟雨、双池碧荷、鸳鸯树、别有天等。山上摩崖石刻，年代最早且字体最大者为南宋赵汝耒所书"锦岩"二字，每字大逾五尺；字数最多者为明末李充茂所书《丹霞山记》，全文1344字。
　　从别传寺出来，在二关门后沿铁索攀登上一道几乎是垂直的石级小路，便来到了丹霞山的最上层---山顶景观层。这里不但是观日出的最佳去处，而且还有螺顶浮屠、乳泉春溜、玉台爽气、虹桥拥翠等古今称颂的景观，澹归和沿墓也建在这里。
　　丹霞山下，有一座狭长形的水库“翔龙湖”。环湖有三岩、六洞、一十八峰，山光水色，十分诱人。
　　隔锦江与丹霞山相望，有一挺拔、高峻、酷肖男性生殖器的山石--阳元石，其高28米，直径7米，是世界同类山石中最高大的，堪称世界一绝！离阳元山不远，有一座坤元山，仿如仰卧着的美女。这一带我们看到的建在悬崖峭壁之上的古山寨，则是当年山民百姓为避战乱或匪乱的临时居所。